باشگاه فوتبال بایر لورکوزن (به آلمانی: TSV Bayer 04 Leverkusen Fußball) باشگاه فوتبال آلمانی است که در لورکوزن یکی از شهرهای ایالت نوردراین-وستفالن قرار دارد.
این باشگاه ورزشی به علاوه فوتبال در رشته های ژیمناستیک، بسکتبال ٬ دو و میدانی و... فعالیت دارد.
بایر لورکوزن در اول ژوئیه ۱۹۰۴ توسط فردریش بایر تاسیس شد. عمده شهرت این باشگاه در رشته فوتبال بوده است
این شهرت از زمانی آغاز شد که این تیم در سال ۱۹۸۸ به فینال جام یوفا رسید و توانست اسپانیول را شکست دهد. در سال های دهه 90 آنها همواره در سایه دو رقیب اصلی خود یعنی بایرن مونیخ و بوروسیا دورتموند بودند. حرکت رو به رشد آنها ادامه داشت تا اینکه در فصل ۰۲-۲۰۰۱ به فینال جام باشگاه های اروپا رسیدند. در فینال مغلوب رئال مادرید شدند، اما خود را به عنوان یک قدرت در فوتبال آلمان و اروپا مطرح نمودند. پس از آن، لورکوزن در یک مسیر نزولی قرارگرفت و با خروج میشاییل بالاک و زی روبرتو این روند تشدید شد